2時間スペシャルとなる特別編では、本編のスペシャルダイジェストに加え、多部未華子演じるメイと、大森南朋演じるナギサさんの新婚生活や、田所（瀬戸康史）らほかのキャラクターたちのその後も描かれる。
最終回では、トライアルを経て、ついに結ばれたメイとナギサさん。結婚してそれから1か月が経ったある日、はじめての夫婦喧嘩をしてしまう2人。メイは職場の面々に、ナギサさんは田所に相談。これを受けた田所や薫（高橋メアリージュン）たちにも、様々な変化が――というストーリー。
「どうしても＜その後＞を描かずにはいられなかった」と語るドラマプロデューサーは、「夫婦になったメイとナギサさんの結婚生活には、一体どんなことが起きるのでしょうか。１話から最終話までの名場面を振り返りながら、新婚のふたりの日常を覗き見してみてください！ きっと思わずにやけてしまうはず」とコメントしている。
ビッ
— 【公式】火曜ドラマ『私の家政夫ナギサさん』毎週火曜よる10時 (@watanagi_tbs) September 1, 2020
喜んでくれ#わたナギ まだまだ終わりません
そして来週は２時間スペシャ#新婚おじキュン！特別編#9月8日よる8時57分スタート#私の家政夫ナギサさん#多部未華子 #大森南朋 #瀬戸康史 #TBS pic.twitter.com/fZqJDPvzBo
「私の家政夫ナギサさん 新婚おじキュン！特別編」は9月8日（火）20時57分～TBSにて2時間スペシャル。
